Además de las funciones comunes a todos los organismos de la Administración Central del Estado, el Ministerio de la Agricultura tiene las específicas siguientes:

1. Proponer al Gobierno las políticas agrarias del país, implementando su   ejecución una vez aprobadas.

2. Dirigir y controlar la política del Estado y Gobierno sobre la producción agropecuaria y forestal para la satisfacción de las necesidades alimentarias de la población, la industria y la exportación.

3. Ejecutar el registro de la propiedad y posesión de la tierra, tractores y máquinas agrícolas autopropulsadas, controlando el fondo de tierra agrícola del país y la jurisdicción sobre la misma.

4. Gestionar  la conservación, mejoramiento y  manejo sostenible de los suelos y uso de los fertilizantes.

5. Implementar la protección del territorio nacional de la introducción y difusión de plagas y enfermedades de las plantas, de manera que se logre un estado fitosanitario satisfactorio en el país, ejerciendo el registro y control del uso de plaguicidas químicos, biológicos y naturales.

6. Dirigir la protección del territorio nacional de la introducción de enfermedades de origen animal y lograr un estado de salud animal satisfactorio en el país, registrar y controlar el uso de las materias primas, productos y subproductos para estos fines  y medicamentos de uso veterinario.

7. Controlar el patrimonio ganadero del país, registrando el ganado mayor, las razas puras y sus cruzamientos y el estándar morfológico de las diferentes especies.

8. Implementar  la política del desarrollo genético, la preservación del genofondo de la especie animal de la fauna doméstica y silvestre.

9. Gestionar el aprovechamiento y uso del patrimonio agroforestal incluyendo los frutales,  la administración y conservación del fondo nacional  forestal.

10. Promover el desarrollo de los sistemas de mecanización, riego y drenaje agrícola, validar la introducción de nuevas tecnologías y su eficiente explotación y establecer las regulaciones  para su asistencia técnica.

11. Dirigir la implementación de la política de prospección, conservación, introducción, mantenimiento, documentación y utilización de los recursos fitogenéticos y de semillas en el país.

12. Ejecutar y hacer cumplir la política para el proceso de fomento, desarrollo y consolidación del movimiento cooperativo en el sector agropecuario, forestal y azucarero.